Qastroenterologiya şöbəmizdə qida borusu, mədə, nazik bağırsaq, yoğun bağırsaq eləcədə qaraciyər, öd kisəsi, öd yolları, mədəaltı vəzi kimi orqanların və ümumilikdə həzm sistemi xəstəliklərinin müayinə və müalicəsi yüksək səviyyədə həyata keçirilir. Şöbəmizdə eyni zamanda ən müasir avadanlıqlarla qastroskopiya, kolonoskopiya, diaqnostik və müalicə məqsədi ilə ERCP kimi prosedurlar aparılır.